Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R1BQ9UD71 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms