Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DBF4Q9UBU7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DBF4Q9UBU7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms