Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
DKK3Q9UBP4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DKK3Q9UBP4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms