Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRBP1Q9P2E9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRBP1Q9P2E9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms