Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC88CQ9P219 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms