Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO1Q9P1Z2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO1Q9P1Z2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms