Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNRD1Q9P1U0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms