Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NKIRAS1Q9NYS0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms