Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC10Q9NYD6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC10Q9NYD6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms