Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO28Q9NVF7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms