Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB4Q9NTQ9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB4Q9NTQ9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms