Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF275Q9NSD4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF275Q9NSD4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF275Q9NSD4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF275Q9NSD4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms