Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPAG4Q9NPE6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPAG4Q9NPE6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms