Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGRNQ9NPE2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGRNQ9NPE2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms