Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB18Q9NP72 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms