Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGAP3Q9NP61 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms