Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEBOXQ9HB31 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms