Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN2Q9H4D0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLSTN2Q9H4D0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms