Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM60Q9H2L4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM60Q9H2L4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms