Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC90BQ9GZT6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms