Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SEMA4CQ9C0C4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms