Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNTNAP4Q9C0A0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms