Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PCGF6Q9BYE7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PCGF6Q9BYE7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms