Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNHG12Q9BXW3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms