Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAIPQ9BWF2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAIPQ9BWF2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAIPQ9BWF2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAIPQ9BWF2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms