Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFAF3Q9BU61 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFAF3Q9BU61 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms