Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms