Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RHOXF2Q9BQY4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RHOXF2Q9BQY4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms