Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF25Q9BQ70 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TCF25Q9BQ70 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms