Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GAL3ST1Q99999 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GAL3ST1Q99999 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms