Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMG1Q96Q15 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG1Q96Q15 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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