Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMTK3Q96Q04 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMTK3Q96Q04 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms