Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC43Q96MW1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC43Q96MW1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms