Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC7Q96M83 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms