Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRRC1Q96M27 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRRC1Q96M27 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms