Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNBD2Q96M20 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNBD2Q96M20 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms