Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPZA3Q96KX2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms