Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPGRIP1Q96KN7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms