Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC136Q96JN2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms