Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCD1Q96GM5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms