Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC35A4Q96G79 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC35A4Q96G79 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms