Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CPNE2Q96FN4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms