Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms