Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNFT2Q96EX2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms