Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms