Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFT1Q96AA3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms