Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRF1Q92994 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRF1Q92994 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms