Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PRG4Q92954 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRG4Q92954 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms