Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOPBP1Q92547 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TOPBP1Q92547 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TOPBP1Q92547 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms