Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPF31Q8WWY3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms